根据教育部最新公布的《普通高等学校本科专业目录》可知，生物工程类专业属于工学门类，包括生物工程、生物制药、合成生物学等3个专业，具体名单一览表如下：
其中特设专业在专业代码后加T表示，国家控制布点专业在专业代码后加K表示。
| 序 号 | 门类 | 专业类 | 专业代码 | 专业名称 | 授予学位 | 修业年限 |
| 1 | 工学 | 生物工程类 | 083001 | 生物工程 | 工学 | 四年 |
| 2 | 工学 | 生物工程类 | 083002T | 生物制药 | 工学 | 四年 |
| 3 | 工学 | 生物工程类 | 083003T | 合成生物学 | 工学 | 四年 |
生物工程专业简介：
生物工程专业通过掌握生物技术及其产业化的科学原理、工艺技术过程和工程设计等基础理论，基本技能，培养能在生物技术与工程领域从事设计生产管理和新技术研究、新产品开发的工程技术人才。
主干课程：高等数学、线性代数、无机化学与化学分析、植物组织培养技术、有机化学、生物化学、化工原理、生化工程、微生物学、细胞生物学、遗传学、分子生物学、基因工程、细胞工程、蛋白质工程、微生物工程、生物工程下游技术、发酵工程设备、概率论与数理统计、动物生理学、生态学等。
生物制药专业简介：
培养具有良好的人文素养和扎实的自然科学基本理论知识，有较强的生物制药理论基础与实践技能，了解学科和产业发展趋势，能在生物医药、生物制品及相关领域从事研发、生产、质控等工作，并具有一定营销、管理等知识的现代生命科学与生物医药产业亟需的高层次人才。
主要课程有：生物化学、基因工程、免疫学、药理学、生物制药工艺学、药剂学、药物分析等。
合成生物学专业简介：
合成生物学，是一门普通高等学校本科专业，基本修业年限为4年，授予工学学士学位。
培养适应社会主义现代化建设需要、德智体美全面发展，具备良好职业道德，具备合成生物技术基本理论和专业知识，并能分析和解决重大环保、能源、生物医药、信息、轻工、食品、和军工等应用领域的工程问题的能力，具有创新精神、和较好的国际交流能力的高级工程技术人才。
主要课程有：合成生物学、生物化学、有机合成化学、代谢工程、生物信息学、化学生物学、基因工程、生物制药工程、环境生物技术，能源生物技术等，以及相关实验。